Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH19

Csnka2ip, Casein kinase II subunit alpha'-interacting protein, mousemouse

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Length 720 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnka2ipQ8CH19 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Csnka2ipQ8CH19 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Csnka2ipQ8CH19 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Csnka2ipQ8CH19 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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