Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN8

Ccdc38, Coiled-coil domain-containing protein 38, mousemouse

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Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc38Q8CDN8 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Ccdc38Q8CDN8 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc38Q8CDN8 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Ccdc38Q8CDN8 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Ccdc38Q8CDN8 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Ccdc38Q8CDN8 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Ccdc38Q8CDN8 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Ccdc38Q8CDN8 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Ccdc38Q8CDN8 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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