Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDG5

Crebrf, CREB3 regulatory factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrebrfQ8CDG5 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CrebrfQ8CDG5 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CrebrfQ8CDG5 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CrebrfQ8CDG5 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CrebrfQ8CDG5 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CrebrfQ8CDG5 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CrebrfQ8CDG5 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CrebrfQ8CDG5 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CrebrfQ8CDG5 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CrebrfQ8CDG5 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CrebrfQ8CDG5 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CrebrfQ8CDG5 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CrebrfQ8CDG5 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CrebrfQ8CDG5 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CrebrfQ8CDG5 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CrebrfQ8CDG5 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CrebrfQ8CDG5 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CrebrfQ8CDG5 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CrebrfQ8CDG5 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CrebrfQ8CDG5 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CrebrfQ8CDG5 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CrebrfQ8CDG5 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CrebrfQ8CDG5 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CrebrfQ8CDG5 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CrebrfQ8CDG5 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CrebrfQ8CDG5 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CrebrfQ8CDG5 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CrebrfQ8CDG5 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CrebrfQ8CDG5 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CrebrfQ8CDG5 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CrebrfQ8CDG5 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CrebrfQ8CDG5 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CrebrfQ8CDG5 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CrebrfQ8CDG5 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CrebrfQ8CDG5 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CrebrfQ8CDG5 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CrebrfQ8CDG5 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CrebrfQ8CDG5 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CrebrfQ8CDG5 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CrebrfQ8CDG5 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CrebrfQ8CDG5 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CrebrfQ8CDG5 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CrebrfQ8CDG5 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CrebrfQ8CDG5 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CrebrfQ8CDG5 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CrebrfQ8CDG5 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CrebrfQ8CDG5 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CrebrfQ8CDG5 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CrebrfQ8CDG5 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CrebrfQ8CDG5 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CrebrfQ8CDG5 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CrebrfQ8CDG5 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CrebrfQ8CDG5 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CrebrfQ8CDG5 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CrebrfQ8CDG5 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CrebrfQ8CDG5 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CrebrfQ8CDG5 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CrebrfQ8CDG5 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CrebrfQ8CDG5 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CrebrfQ8CDG5 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CrebrfQ8CDG5 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CrebrfQ8CDG5 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CrebrfQ8CDG5 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CrebrfQ8CDG5 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CrebrfQ8CDG5 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CrebrfQ8CDG5 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CrebrfQ8CDG5 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CrebrfQ8CDG5 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CrebrfQ8CDG5 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CrebrfQ8CDG5 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CrebrfQ8CDG5 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CrebrfQ8CDG5 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CrebrfQ8CDG5 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CrebrfQ8CDG5 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CrebrfQ8CDG5 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CrebrfQ8CDG5 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CrebrfQ8CDG5 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CrebrfQ8CDG5 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CrebrfQ8CDG5 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CrebrfQ8CDG5 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CrebrfQ8CDG5 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CrebrfQ8CDG5 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CrebrfQ8CDG5 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CrebrfQ8CDG5 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CrebrfQ8CDG5 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CrebrfQ8CDG5 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CrebrfQ8CDG5 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CrebrfQ8CDG5 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CrebrfQ8CDG5 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CrebrfQ8CDG5 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CrebrfQ8CDG5 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CrebrfQ8CDG5 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CrebrfQ8CDG5 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CrebrfQ8CDG5 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CrebrfQ8CDG5 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CrebrfQ8CDG5 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CrebrfQ8CDG5 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CrebrfQ8CDG5 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CrebrfQ8CDG5 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CrebrfQ8CDG5 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms