Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nhlrc3Q8CCH2 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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