Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBF3

Ephb1, Ephrin type-B receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 984 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb1Q8CBF3 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ephb1Q8CBF3 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ephb1Q8CBF3 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms