Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAS9

Parp9, Poly [ADP-ribose] polymerase 9, mousemouse

Predictions only

Length 866 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp9Q8CAS9 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Parp9Q8CAS9 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Parp9Q8CAS9 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Parp9Q8CAS9 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Parp9Q8CAS9 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Parp9Q8CAS9 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Parp9Q8CAS9 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Parp9Q8CAS9 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Parp9Q8CAS9 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Parp9Q8CAS9 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Parp9Q8CAS9 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Parp9Q8CAS9 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Parp9Q8CAS9 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Parp9Q8CAS9 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Parp9Q8CAS9 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Parp9Q8CAS9 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Parp9Q8CAS9 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Parp9Q8CAS9 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Parp9Q8CAS9 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Parp9Q8CAS9 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Parp9Q8CAS9 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Parp9Q8CAS9 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Parp9Q8CAS9 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Parp9Q8CAS9 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Parp9Q8CAS9 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Parp9Q8CAS9 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Parp9Q8CAS9 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Parp9Q8CAS9 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Parp9Q8CAS9 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Parp9Q8CAS9 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Parp9Q8CAS9 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Parp9Q8CAS9 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Parp9Q8CAS9 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Parp9Q8CAS9 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Parp9Q8CAS9 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Parp9Q8CAS9 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Parp9Q8CAS9 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Parp9Q8CAS9 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Parp9Q8CAS9 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Parp9Q8CAS9 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Parp9Q8CAS9 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Parp9Q8CAS9 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Parp9Q8CAS9 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Parp9Q8CAS9 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Parp9Q8CAS9 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Parp9Q8CAS9 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Parp9Q8CAS9 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Parp9Q8CAS9 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Parp9Q8CAS9 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Parp9Q8CAS9 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Parp9Q8CAS9 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Parp9Q8CAS9 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Parp9Q8CAS9 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Parp9Q8CAS9 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Parp9Q8CAS9 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Parp9Q8CAS9 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Parp9Q8CAS9 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Parp9Q8CAS9 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Parp9Q8CAS9 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Parp9Q8CAS9 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Parp9Q8CAS9 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Parp9Q8CAS9 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Parp9Q8CAS9 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Parp9Q8CAS9 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Parp9Q8CAS9 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Parp9Q8CAS9 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Parp9Q8CAS9 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Parp9Q8CAS9 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Parp9Q8CAS9 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Parp9Q8CAS9 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Parp9Q8CAS9 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Parp9Q8CAS9 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Parp9Q8CAS9 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Parp9Q8CAS9 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Parp9Q8CAS9 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Parp9Q8CAS9 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Parp9Q8CAS9 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Parp9Q8CAS9 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Parp9Q8CAS9 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Parp9Q8CAS9 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Parp9Q8CAS9 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Parp9Q8CAS9 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Parp9Q8CAS9 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Parp9Q8CAS9 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Parp9Q8CAS9 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Parp9Q8CAS9 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Parp9Q8CAS9 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Parp9Q8CAS9 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Parp9Q8CAS9 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Parp9Q8CAS9 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Parp9Q8CAS9 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Parp9Q8CAS9 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Parp9Q8CAS9 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Parp9Q8CAS9 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Parp9Q8CAS9 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Parp9Q8CAS9 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Parp9Q8CAS9 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Parp9Q8CAS9 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Parp9Q8CAS9 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Parp9Q8CAS9 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms