Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5W0

Clmn, Calmin, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmnQ8C5W0 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClmnQ8C5W0 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClmnQ8C5W0 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClmnQ8C5W0 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClmnQ8C5W0 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClmnQ8C5W0 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClmnQ8C5W0 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClmnQ8C5W0 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClmnQ8C5W0 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClmnQ8C5W0 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClmnQ8C5W0 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClmnQ8C5W0 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClmnQ8C5W0 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClmnQ8C5W0 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ClmnQ8C5W0 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClmnQ8C5W0 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClmnQ8C5W0 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClmnQ8C5W0 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClmnQ8C5W0 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClmnQ8C5W0 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClmnQ8C5W0 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClmnQ8C5W0 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClmnQ8C5W0 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ClmnQ8C5W0 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClmnQ8C5W0 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClmnQ8C5W0 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ClmnQ8C5W0 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClmnQ8C5W0 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ClmnQ8C5W0 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClmnQ8C5W0 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClmnQ8C5W0 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClmnQ8C5W0 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClmnQ8C5W0 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClmnQ8C5W0 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClmnQ8C5W0 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClmnQ8C5W0 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClmnQ8C5W0 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClmnQ8C5W0 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClmnQ8C5W0 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClmnQ8C5W0 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClmnQ8C5W0 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClmnQ8C5W0 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClmnQ8C5W0 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClmnQ8C5W0 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClmnQ8C5W0 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClmnQ8C5W0 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClmnQ8C5W0 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ClmnQ8C5W0 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ClmnQ8C5W0 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ClmnQ8C5W0 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ClmnQ8C5W0 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ClmnQ8C5W0 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ClmnQ8C5W0 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ClmnQ8C5W0 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ClmnQ8C5W0 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ClmnQ8C5W0 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ClmnQ8C5W0 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ClmnQ8C5W0 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ClmnQ8C5W0 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ClmnQ8C5W0 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ClmnQ8C5W0 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ClmnQ8C5W0 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ClmnQ8C5W0 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ClmnQ8C5W0 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ClmnQ8C5W0 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ClmnQ8C5W0 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ClmnQ8C5W0 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ClmnQ8C5W0 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ClmnQ8C5W0 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ClmnQ8C5W0 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ClmnQ8C5W0 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ClmnQ8C5W0 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ClmnQ8C5W0 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ClmnQ8C5W0 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ClmnQ8C5W0 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ClmnQ8C5W0 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ClmnQ8C5W0 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ClmnQ8C5W0 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ClmnQ8C5W0 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ClmnQ8C5W0 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ClmnQ8C5W0 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ClmnQ8C5W0 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ClmnQ8C5W0 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ClmnQ8C5W0 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ClmnQ8C5W0 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ClmnQ8C5W0 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ClmnQ8C5W0 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ClmnQ8C5W0 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ClmnQ8C5W0 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ClmnQ8C5W0 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ClmnQ8C5W0 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ClmnQ8C5W0 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ClmnQ8C5W0 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ClmnQ8C5W0 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ClmnQ8C5W0 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ClmnQ8C5W0 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ClmnQ8C5W0 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ClmnQ8C5W0 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ClmnQ8C5W0 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ClmnQ8C5W0 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms