Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5C9

TPA-induced transmembrane protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C5C9 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8C5C9 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8C5C9 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8C5C9 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8C5C9 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8C5C9 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q8C5C9 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q8C5C9 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8C5C9 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8C5C9 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8C5C9 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8C5C9 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8C5C9 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8C5C9 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8C5C9 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8C5C9 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8C5C9 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8C5C9 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8C5C9 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8C5C9 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8C5C9 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8C5C9 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8C5C9 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8C5C9 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8C5C9 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8C5C9 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8C5C9 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8C5C9 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8C5C9 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8C5C9 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8C5C9 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8C5C9 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8C5C9 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8C5C9 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8C5C9 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8C5C9 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8C5C9 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8C5C9 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8C5C9 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8C5C9 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8C5C9 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8C5C9 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8C5C9 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8C5C9 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8C5C9 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8C5C9 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8C5C9 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8C5C9 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8C5C9 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8C5C9 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8C5C9 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8C5C9 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8C5C9 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8C5C9 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8C5C9 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8C5C9 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.8 ms