Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

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Length 508 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FarsaQ8C0C7 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FarsaQ8C0C7 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FarsaQ8C0C7 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
FarsaQ8C0C7 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
FarsaQ8C0C7 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FarsaQ8C0C7 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FarsaQ8C0C7 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FarsaQ8C0C7 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FarsaQ8C0C7 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FarsaQ8C0C7 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FarsaQ8C0C7 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
FarsaQ8C0C7 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FarsaQ8C0C7 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
FarsaQ8C0C7 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
FarsaQ8C0C7 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FarsaQ8C0C7 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FarsaQ8C0C7 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FarsaQ8C0C7 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FarsaQ8C0C7 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FarsaQ8C0C7 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FarsaQ8C0C7 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FarsaQ8C0C7 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FarsaQ8C0C7 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FarsaQ8C0C7 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FarsaQ8C0C7 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FarsaQ8C0C7 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FarsaQ8C0C7 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FarsaQ8C0C7 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FarsaQ8C0C7 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FarsaQ8C0C7 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FarsaQ8C0C7 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FarsaQ8C0C7 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FarsaQ8C0C7 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FarsaQ8C0C7 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FarsaQ8C0C7 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FarsaQ8C0C7 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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FarsaQ8C0C7 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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FarsaQ8C0C7 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FarsaQ8C0C7 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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FarsaQ8C0C7 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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FarsaQ8C0C7 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FarsaQ8C0C7 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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