Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Gm10226-201ENSMUST00000072133 255 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Olfr154-201ENSMUST00000099918 1079 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Gm11342-203ENSMUST00000224879 1324 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Gm14837-201ENSMUST00000119688 206 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Gm8480-201ENSMUST00000190350 698 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Gm17771-201ENSMUST00000194477 1147 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Vmn1r38-203ENSMUST00000227694 909 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Olfr914-201ENSMUST00000057755 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Vmn1r37-201ENSMUST00000077482 909 ntAPPRIS P2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Scp2-ps2-203ENSMUST00000216438 1370 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Gm42435-201ENSMUST00000196630 1448 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Gm13674-201ENSMUST00000121276 823 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Gm13330-201ENSMUST00000136400 388 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Gm28011-201ENSMUST00000184097 175 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Gm4035-201ENSMUST00000189445 399 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Gm37989-201ENSMUST00000195202 803 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Gm44909-201ENSMUST00000208756 165 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Trim35Q8C006 Gm19428-202ENSMUST00000220573 1038 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Nat8f5-201ENSMUST00000032074 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Trim35Q8C006 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 4930517J16Rik-201ENSMUST00000193095 1568 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Sp3os-203ENSMUST00000137941 628 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Gm29286-202ENSMUST00000187736 537 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Gm28987-201ENSMUST00000191071 537 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 Gm7631-201ENSMUST00000196935 1100 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 4930542C16Rik-203ENSMUST00000212108 1207 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim35Q8C006 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms