Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp38Q8BW70 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp38Q8BW70 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp38Q8BW70 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp38Q8BW70 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp38Q8BW70 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp38Q8BW70 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp38Q8BW70 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp38Q8BW70 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp38Q8BW70 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp38Q8BW70 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp38Q8BW70 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp38Q8BW70 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp38Q8BW70 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp38Q8BW70 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp38Q8BW70 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp38Q8BW70 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp38Q8BW70 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp38Q8BW70 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp38Q8BW70 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp38Q8BW70 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp38Q8BW70 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp38Q8BW70 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp38Q8BW70 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp38Q8BW70 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp38Q8BW70 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp38Q8BW70 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp38Q8BW70 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp38Q8BW70 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Usp38Q8BW70 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp38Q8BW70 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp38Q8BW70 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp38Q8BW70 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp38Q8BW70 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Usp38Q8BW70 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Usp38Q8BW70 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp38Q8BW70 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp38Q8BW70 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Usp38Q8BW70 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp38Q8BW70 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp38Q8BW70 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Usp38Q8BW70 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp38Q8BW70 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp38Q8BW70 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp38Q8BW70 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp38Q8BW70 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp38Q8BW70 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp38Q8BW70 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Usp38Q8BW70 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp38Q8BW70 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp38Q8BW70 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp38Q8BW70 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Usp38Q8BW70 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Usp38Q8BW70 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Usp38Q8BW70 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp38Q8BW70 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp38Q8BW70 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp38Q8BW70 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Usp38Q8BW70 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp38Q8BW70 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp38Q8BW70 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp38Q8BW70 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp38Q8BW70 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp38Q8BW70 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp38Q8BW70 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp38Q8BW70 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp38Q8BW70 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp38Q8BW70 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp38Q8BW70 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
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Usp38Q8BW70 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp38Q8BW70 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp38Q8BW70 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp38Q8BW70 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp38Q8BW70 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp38Q8BW70 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp38Q8BW70 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp38Q8BW70 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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