Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx17Q8BVL3 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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