Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Pdcl3Q8BVF2 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms