Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMF5

Grik4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik4Q8BMF5 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Grik4Q8BMF5 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grik4Q8BMF5 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms