Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV1

Gpc2, Glypican-2, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc2Q8BKV1 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpc2Q8BKV1 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms