Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJQ2

Usp1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, mousemouse

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Length 784 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp1Q8BJQ2 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp1Q8BJQ2 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp1Q8BJQ2 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp1Q8BJQ2 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp1Q8BJQ2 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp1Q8BJQ2 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp1Q8BJQ2 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Usp1Q8BJQ2 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp1Q8BJQ2 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp1Q8BJQ2 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp1Q8BJQ2 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp1Q8BJQ2 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp1Q8BJQ2 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp1Q8BJQ2 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp1Q8BJQ2 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp1Q8BJQ2 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Usp1Q8BJQ2 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp1Q8BJQ2 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp1Q8BJQ2 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp1Q8BJQ2 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp1Q8BJQ2 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp1Q8BJQ2 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp1Q8BJQ2 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp1Q8BJQ2 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp1Q8BJQ2 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp1Q8BJQ2 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Usp1Q8BJQ2 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp1Q8BJQ2 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Usp1Q8BJQ2 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Usp1Q8BJQ2 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp1Q8BJQ2 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp1Q8BJQ2 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp1Q8BJQ2 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp1Q8BJQ2 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp1Q8BJQ2 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp1Q8BJQ2 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp1Q8BJQ2 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp1Q8BJQ2 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp1Q8BJQ2 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp1Q8BJQ2 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms