Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIE6

Frmd4a, FERM domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmd4aQ8BIE6 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Frmd4aQ8BIE6 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Frmd4aQ8BIE6 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Frmd4aQ8BIE6 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Frmd4aQ8BIE6 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Frmd4aQ8BIE6 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Frmd4aQ8BIE6 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Frmd4aQ8BIE6 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Frmd4aQ8BIE6 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Frmd4aQ8BIE6 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Frmd4aQ8BIE6 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Frmd4aQ8BIE6 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Frmd4aQ8BIE6 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Frmd4aQ8BIE6 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Frmd4aQ8BIE6 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Frmd4aQ8BIE6 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Frmd4aQ8BIE6 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Frmd4aQ8BIE6 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Frmd4aQ8BIE6 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Frmd4aQ8BIE6 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Frmd4aQ8BIE6 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Frmd4aQ8BIE6 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Frmd4aQ8BIE6 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Frmd4aQ8BIE6 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Frmd4aQ8BIE6 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Frmd4aQ8BIE6 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Frmd4aQ8BIE6 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Frmd4aQ8BIE6 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Frmd4aQ8BIE6 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Frmd4aQ8BIE6 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Frmd4aQ8BIE6 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Frmd4aQ8BIE6 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Frmd4aQ8BIE6 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Frmd4aQ8BIE6 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Frmd4aQ8BIE6 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Frmd4aQ8BIE6 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Frmd4aQ8BIE6 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Frmd4aQ8BIE6 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Frmd4aQ8BIE6 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Frmd4aQ8BIE6 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Frmd4aQ8BIE6 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Frmd4aQ8BIE6 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Frmd4aQ8BIE6 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Frmd4aQ8BIE6 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Frmd4aQ8BIE6 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Frmd4aQ8BIE6 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Frmd4aQ8BIE6 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Frmd4aQ8BIE6 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Frmd4aQ8BIE6 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Frmd4aQ8BIE6 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Frmd4aQ8BIE6 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Frmd4aQ8BIE6 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Frmd4aQ8BIE6 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Frmd4aQ8BIE6 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Frmd4aQ8BIE6 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Frmd4aQ8BIE6 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Frmd4aQ8BIE6 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Frmd4aQ8BIE6 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Frmd4aQ8BIE6 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Frmd4aQ8BIE6 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Frmd4aQ8BIE6 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Frmd4aQ8BIE6 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Frmd4aQ8BIE6 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Frmd4aQ8BIE6 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Frmd4aQ8BIE6 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Frmd4aQ8BIE6 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Frmd4aQ8BIE6 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Frmd4aQ8BIE6 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Frmd4aQ8BIE6 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Frmd4aQ8BIE6 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Frmd4aQ8BIE6 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Frmd4aQ8BIE6 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Frmd4aQ8BIE6 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Frmd4aQ8BIE6 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Frmd4aQ8BIE6 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Frmd4aQ8BIE6 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Frmd4aQ8BIE6 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Frmd4aQ8BIE6 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Frmd4aQ8BIE6 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Frmd4aQ8BIE6 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Frmd4aQ8BIE6 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Frmd4aQ8BIE6 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Frmd4aQ8BIE6 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Frmd4aQ8BIE6 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Frmd4aQ8BIE6 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Frmd4aQ8BIE6 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Frmd4aQ8BIE6 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Frmd4aQ8BIE6 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Frmd4aQ8BIE6 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Frmd4aQ8BIE6 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Frmd4aQ8BIE6 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Frmd4aQ8BIE6 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Frmd4aQ8BIE6 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Frmd4aQ8BIE6 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Frmd4aQ8BIE6 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Frmd4aQ8BIE6 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Frmd4aQ8BIE6 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Frmd4aQ8BIE6 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Frmd4aQ8BIE6 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Frmd4aQ8BIE6 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms