Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
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Htatsf1Q8BGC0 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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Htatsf1Q8BGC0 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Htatsf1Q8BGC0 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms