Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFX1

Rnf187, E3 ubiquitin-protein ligase RNF187, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf187Q8BFX1 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf187Q8BFX1 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf187Q8BFX1 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf187Q8BFX1 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf187Q8BFX1 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf187Q8BFX1 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf187Q8BFX1 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Rnf187Q8BFX1 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf187Q8BFX1 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf187Q8BFX1 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf187Q8BFX1 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf187Q8BFX1 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Rnf187Q8BFX1 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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Rnf187Q8BFX1 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Rnf187Q8BFX1 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf187Q8BFX1 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Rnf187Q8BFX1 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf187Q8BFX1 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Rnf187Q8BFX1 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf187Q8BFX1 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf187Q8BFX1 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Rnf187Q8BFX1 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Rnf187Q8BFX1 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Rnf187Q8BFX1 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Rnf187Q8BFX1 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Rnf187Q8BFX1 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Rnf187Q8BFX1 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Rnf187Q8BFX1 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf187Q8BFX1 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Rnf187Q8BFX1 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf187Q8BFX1 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf187Q8BFX1 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Rnf187Q8BFX1 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Rnf187Q8BFX1 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms