Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-M10.4Q85ZW8 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
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