Protein–RNA interactions for Protein: Q810L4

Tmem39b, Transmembrane protein 39B, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem39bQ810L4 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem39bQ810L4 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tmem39bQ810L4 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tmem39bQ810L4 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tmem39bQ810L4 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tmem39bQ810L4 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem39bQ810L4 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem39bQ810L4 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem39bQ810L4 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem39bQ810L4 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem39bQ810L4 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem39bQ810L4 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms