Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z71

Tnn, Tenascin-N, mousemouse

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnnQ80Z71 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TnnQ80Z71 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TnnQ80Z71 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TnnQ80Z71 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TnnQ80Z71 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TnnQ80Z71 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TnnQ80Z71 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TnnQ80Z71 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TnnQ80Z71 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TnnQ80Z71 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TnnQ80Z71 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TnnQ80Z71 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TnnQ80Z71 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TnnQ80Z71 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TnnQ80Z71 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TnnQ80Z71 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TnnQ80Z71 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TnnQ80Z71 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TnnQ80Z71 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TnnQ80Z71 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TnnQ80Z71 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TnnQ80Z71 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TnnQ80Z71 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TnnQ80Z71 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TnnQ80Z71 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TnnQ80Z71 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TnnQ80Z71 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TnnQ80Z71 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TnnQ80Z71 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TnnQ80Z71 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TnnQ80Z71 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TnnQ80Z71 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TnnQ80Z71 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TnnQ80Z71 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TnnQ80Z71 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TnnQ80Z71 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TnnQ80Z71 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TnnQ80Z71 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TnnQ80Z71 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TnnQ80Z71 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TnnQ80Z71 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TnnQ80Z71 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TnnQ80Z71 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TnnQ80Z71 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TnnQ80Z71 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TnnQ80Z71 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TnnQ80Z71 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TnnQ80Z71 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TnnQ80Z71 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TnnQ80Z71 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TnnQ80Z71 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TnnQ80Z71 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TnnQ80Z71 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TnnQ80Z71 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TnnQ80Z71 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TnnQ80Z71 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TnnQ80Z71 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TnnQ80Z71 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TnnQ80Z71 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TnnQ80Z71 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TnnQ80Z71 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TnnQ80Z71 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TnnQ80Z71 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TnnQ80Z71 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TnnQ80Z71 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TnnQ80Z71 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TnnQ80Z71 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TnnQ80Z71 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TnnQ80Z71 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TnnQ80Z71 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TnnQ80Z71 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TnnQ80Z71 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TnnQ80Z71 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TnnQ80Z71 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TnnQ80Z71 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TnnQ80Z71 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TnnQ80Z71 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TnnQ80Z71 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TnnQ80Z71 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TnnQ80Z71 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TnnQ80Z71 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TnnQ80Z71 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TnnQ80Z71 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TnnQ80Z71 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TnnQ80Z71 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TnnQ80Z71 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TnnQ80Z71 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TnnQ80Z71 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TnnQ80Z71 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TnnQ80Z71 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TnnQ80Z71 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TnnQ80Z71 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TnnQ80Z71 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TnnQ80Z71 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TnnQ80Z71 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TnnQ80Z71 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TnnQ80Z71 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TnnQ80Z71 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TnnQ80Z71 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TnnQ80Z71 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 152.3 ms