Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pcsk9Q80W65 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pcsk9Q80W65 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Pcsk9Q80W65 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pcsk9Q80W65 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pcsk9Q80W65 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Pcsk9Q80W65 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pcsk9Q80W65 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pcsk9Q80W65 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcsk9Q80W65 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcsk9Q80W65 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcsk9Q80W65 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcsk9Q80W65 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcsk9Q80W65 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Pcsk9Q80W65 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcsk9Q80W65 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcsk9Q80W65 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcsk9Q80W65 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Pcsk9Q80W65 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcsk9Q80W65 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcsk9Q80W65 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcsk9Q80W65 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcsk9Q80W65 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Pcsk9Q80W65 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Pcsk9Q80W65 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Pcsk9Q80W65 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Pcsk9Q80W65 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Pcsk9Q80W65 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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