Protein–RNA interactions for Protein: Q80U57

Rims3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims3Q80U57 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rims3Q80U57 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rims3Q80U57 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rims3Q80U57 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rims3Q80U57 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rims3Q80U57 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rims3Q80U57 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rims3Q80U57 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rims3Q80U57 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rims3Q80U57 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rims3Q80U57 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rims3Q80U57 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rims3Q80U57 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rims3Q80U57 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rims3Q80U57 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rims3Q80U57 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rims3Q80U57 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rims3Q80U57 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rims3Q80U57 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rims3Q80U57 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rims3Q80U57 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rims3Q80U57 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rims3Q80U57 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rims3Q80U57 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rims3Q80U57 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rims3Q80U57 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rims3Q80U57 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rims3Q80U57 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rims3Q80U57 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rims3Q80U57 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rims3Q80U57 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rims3Q80U57 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rims3Q80U57 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rims3Q80U57 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rims3Q80U57 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rims3Q80U57 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rims3Q80U57 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rims3Q80U57 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rims3Q80U57 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rims3Q80U57 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rims3Q80U57 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rims3Q80U57 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rims3Q80U57 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rims3Q80U57 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rims3Q80U57 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rims3Q80U57 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rims3Q80U57 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rims3Q80U57 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rims3Q80U57 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rims3Q80U57 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rims3Q80U57 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rims3Q80U57 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rims3Q80U57 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rims3Q80U57 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rims3Q80U57 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rims3Q80U57 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rims3Q80U57 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rims3Q80U57 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rims3Q80U57 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rims3Q80U57 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rims3Q80U57 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rims3Q80U57 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rims3Q80U57 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rims3Q80U57 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rims3Q80U57 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rims3Q80U57 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rims3Q80U57 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rims3Q80U57 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rims3Q80U57 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rims3Q80U57 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rims3Q80U57 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rims3Q80U57 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rims3Q80U57 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rims3Q80U57 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rims3Q80U57 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rims3Q80U57 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rims3Q80U57 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rims3Q80U57 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rims3Q80U57 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rims3Q80U57 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rims3Q80U57 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rims3Q80U57 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rims3Q80U57 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rims3Q80U57 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rims3Q80U57 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rims3Q80U57 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rims3Q80U57 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rims3Q80U57 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rims3Q80U57 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rims3Q80U57 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rims3Q80U57 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rims3Q80U57 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rims3Q80U57 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rims3Q80U57 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rims3Q80U57 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rims3Q80U57 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rims3Q80U57 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rims3Q80U57 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rims3Q80U57 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rims3Q80U57 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
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