Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NischQ80TM9 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NischQ80TM9 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NischQ80TM9 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
NischQ80TM9 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
NischQ80TM9 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
NischQ80TM9 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
NischQ80TM9 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
NischQ80TM9 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NischQ80TM9 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
NischQ80TM9 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
NischQ80TM9 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
NischQ80TM9 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
NischQ80TM9 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NischQ80TM9 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NischQ80TM9 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NischQ80TM9 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NischQ80TM9 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NischQ80TM9 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NischQ80TM9 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NischQ80TM9 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NischQ80TM9 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NischQ80TM9 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NischQ80TM9 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NischQ80TM9 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NischQ80TM9 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NischQ80TM9 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NischQ80TM9 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NischQ80TM9 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NischQ80TM9 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NischQ80TM9 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
NischQ80TM9 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
NischQ80TM9 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NischQ80TM9 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NischQ80TM9 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
NischQ80TM9 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
NischQ80TM9 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
NischQ80TM9 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
NischQ80TM9 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NischQ80TM9 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
NischQ80TM9 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NischQ80TM9 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NischQ80TM9 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NischQ80TM9 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NischQ80TM9 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NischQ80TM9 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NischQ80TM9 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NischQ80TM9 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NischQ80TM9 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NischQ80TM9 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NischQ80TM9 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NischQ80TM9 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NischQ80TM9 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NischQ80TM9 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
NischQ80TM9 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NischQ80TM9 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NischQ80TM9 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NischQ80TM9 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NischQ80TM9 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
NischQ80TM9 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NischQ80TM9 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NischQ80TM9 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NischQ80TM9 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NischQ80TM9 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NischQ80TM9 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NischQ80TM9 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NischQ80TM9 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NischQ80TM9 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NischQ80TM9 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NischQ80TM9 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NischQ80TM9 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
NischQ80TM9 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
NischQ80TM9 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NischQ80TM9 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NischQ80TM9 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NischQ80TM9 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NischQ80TM9 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NischQ80TM9 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NischQ80TM9 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NischQ80TM9 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
NischQ80TM9 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NischQ80TM9 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NischQ80TM9 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NischQ80TM9 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
NischQ80TM9 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NischQ80TM9 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NischQ80TM9 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
NischQ80TM9 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NischQ80TM9 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NischQ80TM9 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NischQ80TM9 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NischQ80TM9 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NischQ80TM9 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NischQ80TM9 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
NischQ80TM9 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
NischQ80TM9 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NischQ80TM9 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
NischQ80TM9 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NischQ80TM9 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NischQ80TM9 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
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