Protein–RNA interactions for Protein: Q7TST5

Lamp3, Lysosome-associated membrane glycoprotein 3, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp3Q7TST5 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lamp3Q7TST5 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Lamp3Q7TST5 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lamp3Q7TST5 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lamp3Q7TST5 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Lamp3Q7TST5 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lamp3Q7TST5 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lamp3Q7TST5 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lamp3Q7TST5 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Lamp3Q7TST5 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lamp3Q7TST5 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lamp3Q7TST5 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lamp3Q7TST5 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lamp3Q7TST5 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lamp3Q7TST5 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lamp3Q7TST5 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lamp3Q7TST5 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lamp3Q7TST5 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lamp3Q7TST5 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lamp3Q7TST5 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lamp3Q7TST5 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lamp3Q7TST5 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lamp3Q7TST5 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Lamp3Q7TST5 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lamp3Q7TST5 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lamp3Q7TST5 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lamp3Q7TST5 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lamp3Q7TST5 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lamp3Q7TST5 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lamp3Q7TST5 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lamp3Q7TST5 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lamp3Q7TST5 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lamp3Q7TST5 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lamp3Q7TST5 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lamp3Q7TST5 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lamp3Q7TST5 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lamp3Q7TST5 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Lamp3Q7TST5 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lamp3Q7TST5 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lamp3Q7TST5 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lamp3Q7TST5 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lamp3Q7TST5 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lamp3Q7TST5 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lamp3Q7TST5 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Lamp3Q7TST5 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lamp3Q7TST5 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lamp3Q7TST5 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lamp3Q7TST5 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lamp3Q7TST5 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lamp3Q7TST5 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lamp3Q7TST5 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lamp3Q7TST5 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lamp3Q7TST5 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lamp3Q7TST5 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lamp3Q7TST5 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lamp3Q7TST5 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lamp3Q7TST5 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lamp3Q7TST5 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lamp3Q7TST5 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lamp3Q7TST5 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lamp3Q7TST5 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lamp3Q7TST5 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lamp3Q7TST5 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lamp3Q7TST5 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lamp3Q7TST5 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lamp3Q7TST5 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Lamp3Q7TST5 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lamp3Q7TST5 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lamp3Q7TST5 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lamp3Q7TST5 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lamp3Q7TST5 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lamp3Q7TST5 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Lamp3Q7TST5 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lamp3Q7TST5 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Lamp3Q7TST5 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lamp3Q7TST5 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lamp3Q7TST5 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lamp3Q7TST5 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lamp3Q7TST5 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lamp3Q7TST5 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lamp3Q7TST5 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lamp3Q7TST5 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lamp3Q7TST5 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lamp3Q7TST5 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Lamp3Q7TST5 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Lamp3Q7TST5 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lamp3Q7TST5 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lamp3Q7TST5 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lamp3Q7TST5 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Lamp3Q7TST5 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lamp3Q7TST5 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lamp3Q7TST5 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lamp3Q7TST5 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lamp3Q7TST5 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lamp3Q7TST5 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lamp3Q7TST5 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lamp3Q7TST5 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lamp3Q7TST5 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lamp3Q7TST5 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Lamp3Q7TST5 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms