Protein–RNA interactions for Protein: Q78Y63

Pdcl2, Phosducin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl2Q78Y63 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pdcl2Q78Y63 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdcl2Q78Y63 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdcl2Q78Y63 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdcl2Q78Y63 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdcl2Q78Y63 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdcl2Q78Y63 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdcl2Q78Y63 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdcl2Q78Y63 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdcl2Q78Y63 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdcl2Q78Y63 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdcl2Q78Y63 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdcl2Q78Y63 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdcl2Q78Y63 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdcl2Q78Y63 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdcl2Q78Y63 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdcl2Q78Y63 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdcl2Q78Y63 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdcl2Q78Y63 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdcl2Q78Y63 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdcl2Q78Y63 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdcl2Q78Y63 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdcl2Q78Y63 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdcl2Q78Y63 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdcl2Q78Y63 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdcl2Q78Y63 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdcl2Q78Y63 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdcl2Q78Y63 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdcl2Q78Y63 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdcl2Q78Y63 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdcl2Q78Y63 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdcl2Q78Y63 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdcl2Q78Y63 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdcl2Q78Y63 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdcl2Q78Y63 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdcl2Q78Y63 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdcl2Q78Y63 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdcl2Q78Y63 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdcl2Q78Y63 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdcl2Q78Y63 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdcl2Q78Y63 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdcl2Q78Y63 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdcl2Q78Y63 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdcl2Q78Y63 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdcl2Q78Y63 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdcl2Q78Y63 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdcl2Q78Y63 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdcl2Q78Y63 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdcl2Q78Y63 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdcl2Q78Y63 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdcl2Q78Y63 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdcl2Q78Y63 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdcl2Q78Y63 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms