Protein–RNA interactions for Protein: Q78WZ7

Twistnb, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwistnbQ78WZ7 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TwistnbQ78WZ7 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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