Protein–RNA interactions for Protein: Q78JN3

Eci3, Enoyl-CoA delta isomerase 3, peroxisomal, mousemouse

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Length 317 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eci3Q78JN3 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Eci3Q78JN3 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Eci3Q78JN3 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Eci3Q78JN3 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Eci3Q78JN3 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Eci3Q78JN3 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Eci3Q78JN3 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Eci3Q78JN3 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Eci3Q78JN3 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Eci3Q78JN3 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Eci3Q78JN3 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Eci3Q78JN3 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Eci3Q78JN3 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Eci3Q78JN3 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Eci3Q78JN3 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Eci3Q78JN3 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Eci3Q78JN3 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Eci3Q78JN3 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Eci3Q78JN3 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Eci3Q78JN3 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Eci3Q78JN3 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Eci3Q78JN3 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Eci3Q78JN3 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Eci3Q78JN3 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Eci3Q78JN3 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Eci3Q78JN3 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Eci3Q78JN3 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Eci3Q78JN3 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Eci3Q78JN3 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Eci3Q78JN3 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Eci3Q78JN3 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Eci3Q78JN3 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Eci3Q78JN3 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Eci3Q78JN3 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Eci3Q78JN3 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Eci3Q78JN3 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Eci3Q78JN3 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Eci3Q78JN3 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Eci3Q78JN3 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Eci3Q78JN3 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Eci3Q78JN3 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Eci3Q78JN3 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Eci3Q78JN3 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Eci3Q78JN3 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Eci3Q78JN3 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Eci3Q78JN3 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Eci3Q78JN3 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Eci3Q78JN3 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Eci3Q78JN3 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Eci3Q78JN3 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Eci3Q78JN3 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Eci3Q78JN3 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Eci3Q78JN3 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Eci3Q78JN3 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Eci3Q78JN3 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Eci3Q78JN3 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Eci3Q78JN3 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Eci3Q78JN3 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Eci3Q78JN3 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Eci3Q78JN3 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Eci3Q78JN3 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Eci3Q78JN3 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Eci3Q78JN3 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Eci3Q78JN3 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Eci3Q78JN3 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Eci3Q78JN3 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms