Protein–RNA interactions for Protein: Q70IV5

Synm, Synemin, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynmQ70IV5 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SynmQ70IV5 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SynmQ70IV5 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SynmQ70IV5 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SynmQ70IV5 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SynmQ70IV5 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SynmQ70IV5 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SynmQ70IV5 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SynmQ70IV5 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SynmQ70IV5 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SynmQ70IV5 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SynmQ70IV5 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SynmQ70IV5 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SynmQ70IV5 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SynmQ70IV5 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SynmQ70IV5 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SynmQ70IV5 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SynmQ70IV5 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SynmQ70IV5 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SynmQ70IV5 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SynmQ70IV5 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SynmQ70IV5 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SynmQ70IV5 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SynmQ70IV5 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SynmQ70IV5 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SynmQ70IV5 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SynmQ70IV5 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SynmQ70IV5 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SynmQ70IV5 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SynmQ70IV5 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SynmQ70IV5 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SynmQ70IV5 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SynmQ70IV5 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SynmQ70IV5 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SynmQ70IV5 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SynmQ70IV5 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SynmQ70IV5 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SynmQ70IV5 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SynmQ70IV5 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SynmQ70IV5 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SynmQ70IV5 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SynmQ70IV5 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SynmQ70IV5 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SynmQ70IV5 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SynmQ70IV5 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SynmQ70IV5 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SynmQ70IV5 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SynmQ70IV5 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SynmQ70IV5 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SynmQ70IV5 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SynmQ70IV5 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SynmQ70IV5 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SynmQ70IV5 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SynmQ70IV5 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SynmQ70IV5 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SynmQ70IV5 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SynmQ70IV5 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SynmQ70IV5 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SynmQ70IV5 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SynmQ70IV5 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SynmQ70IV5 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SynmQ70IV5 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SynmQ70IV5 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SynmQ70IV5 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SynmQ70IV5 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SynmQ70IV5 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
SynmQ70IV5 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
SynmQ70IV5 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SynmQ70IV5 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
SynmQ70IV5 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
SynmQ70IV5 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.11
SynmQ70IV5 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
SynmQ70IV5 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
SynmQ70IV5 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.11
SynmQ70IV5 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SynmQ70IV5 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SynmQ70IV5 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SynmQ70IV5 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SynmQ70IV5 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SynmQ70IV5 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SynmQ70IV5 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SynmQ70IV5 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SynmQ70IV5 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SynmQ70IV5 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SynmQ70IV5 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SynmQ70IV5 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SynmQ70IV5 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SynmQ70IV5 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SynmQ70IV5 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SynmQ70IV5 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SynmQ70IV5 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SynmQ70IV5 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SynmQ70IV5 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SynmQ70IV5 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SynmQ70IV5 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SynmQ70IV5 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SynmQ70IV5 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SynmQ70IV5 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SynmQ70IV5 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SynmQ70IV5 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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