Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS8

Spop, Speckle-type POZ protein, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpopQ6ZWS8 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SpopQ6ZWS8 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SpopQ6ZWS8 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SpopQ6ZWS8 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SpopQ6ZWS8 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SpopQ6ZWS8 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SpopQ6ZWS8 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SpopQ6ZWS8 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SpopQ6ZWS8 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SpopQ6ZWS8 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SpopQ6ZWS8 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SpopQ6ZWS8 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SpopQ6ZWS8 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SpopQ6ZWS8 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SpopQ6ZWS8 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SpopQ6ZWS8 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SpopQ6ZWS8 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SpopQ6ZWS8 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SpopQ6ZWS8 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SpopQ6ZWS8 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SpopQ6ZWS8 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SpopQ6ZWS8 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SpopQ6ZWS8 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SpopQ6ZWS8 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SpopQ6ZWS8 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SpopQ6ZWS8 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SpopQ6ZWS8 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SpopQ6ZWS8 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SpopQ6ZWS8 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SpopQ6ZWS8 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SpopQ6ZWS8 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SpopQ6ZWS8 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SpopQ6ZWS8 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SpopQ6ZWS8 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SpopQ6ZWS8 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SpopQ6ZWS8 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SpopQ6ZWS8 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SpopQ6ZWS8 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SpopQ6ZWS8 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SpopQ6ZWS8 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SpopQ6ZWS8 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SpopQ6ZWS8 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SpopQ6ZWS8 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SpopQ6ZWS8 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SpopQ6ZWS8 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SpopQ6ZWS8 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SpopQ6ZWS8 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SpopQ6ZWS8 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SpopQ6ZWS8 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SpopQ6ZWS8 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SpopQ6ZWS8 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SpopQ6ZWS8 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms