Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
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Ccdc88cQ6VGS5 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Ccdc88cQ6VGS5 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
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Ccdc88cQ6VGS5 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Ccdc88cQ6VGS5 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Ccdc88cQ6VGS5 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Ccdc88cQ6VGS5 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc88cQ6VGS5 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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