Protein–RNA interactions for Protein: Q6RHW0

Krt9, Keratin, type I cytoskeletal 9, mousemouse

Predictions only

Length 743 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt9Q6RHW0 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt9Q6RHW0 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt9Q6RHW0 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt9Q6RHW0 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt9Q6RHW0 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt9Q6RHW0 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt9Q6RHW0 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt9Q6RHW0 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt9Q6RHW0 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt9Q6RHW0 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt9Q6RHW0 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt9Q6RHW0 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt9Q6RHW0 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt9Q6RHW0 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt9Q6RHW0 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt9Q6RHW0 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt9Q6RHW0 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt9Q6RHW0 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt9Q6RHW0 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt9Q6RHW0 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt9Q6RHW0 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt9Q6RHW0 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt9Q6RHW0 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt9Q6RHW0 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt9Q6RHW0 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt9Q6RHW0 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt9Q6RHW0 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt9Q6RHW0 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Krt9Q6RHW0 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Krt9Q6RHW0 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt9Q6RHW0 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms