Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtifQ6PEE2 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms