Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD19

UPF0668 protein C10orf76 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6PD19 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q6PD19 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q6PD19 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q6PD19 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6PD19 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6PD19 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6PD19 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6PD19 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6PD19 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6PD19 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6PD19 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6PD19 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6PD19 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6PD19 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6PD19 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6PD19 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6PD19 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6PD19 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6PD19 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6PD19 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6PD19 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6PD19 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6PD19 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6PD19 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6PD19 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6PD19 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6PD19 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6PD19 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6PD19 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6PD19 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6PD19 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6PD19 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6PD19 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6PD19 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6PD19 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6PD19 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6PD19 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6PD19 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6PD19 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6PD19 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6PD19 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6PD19 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6PD19 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6PD19 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q6PD19 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q6PD19 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q6PD19 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q6PD19 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q6PD19 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q6PD19 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q6PD19 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q6PD19 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q6PD19 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q6PD19 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q6PD19 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q6PD19 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q6PD19 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q6PD19 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q6PD19 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q6PD19 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q6PD19 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q6PD19 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Q6PD19 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Q6PD19 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q6PD19 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q6PD19 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q6PD19 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q6PD19 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q6PD19 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q6PD19 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q6PD19 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q6PD19 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q6PD19 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q6PD19 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q6PD19 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q6PD19 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q6PD19 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q6PD19 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q6PD19 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q6PD19 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q6PD19 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q6PD19 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q6PD19 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q6PD19 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q6PD19 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Q6PD19 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q6PD19 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Q6PD19 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q6PD19 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q6PD19 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q6PD19 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q6PD19 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q6PD19 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q6PD19 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q6PD19 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q6PD19 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q6PD19 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q6PD19 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q6PD19 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q6PD19 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms