Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAV2

Herc4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc4Q6PAV2 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Herc4Q6PAV2 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms