Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Tpm4Q6IRU2 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Tpm4Q6IRU2 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Tpm4Q6IRU2 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Tpm4Q6IRU2 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Tpm4Q6IRU2 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Tpm4Q6IRU2 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Tpm4Q6IRU2 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tpm4Q6IRU2 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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