Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRT3

Parpbp, PCNA-interacting partner, mousemouse

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParpbpQ6IRT3 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ParpbpQ6IRT3 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms