Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Smarca2Q6DIC0 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Smarca2Q6DIC0 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Smarca2Q6DIC0 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Smarca2Q6DIC0 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Smarca2Q6DIC0 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Smarca2Q6DIC0 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Smarca2Q6DIC0 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Smarca2Q6DIC0 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Smarca2Q6DIC0 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Smarca2Q6DIC0 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Smarca2Q6DIC0 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Smarca2Q6DIC0 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Smarca2Q6DIC0 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Smarca2Q6DIC0 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Smarca2Q6DIC0 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Smarca2Q6DIC0 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Smarca2Q6DIC0 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Smarca2Q6DIC0 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Smarca2Q6DIC0 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Smarca2Q6DIC0 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Smarca2Q6DIC0 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Smarca2Q6DIC0 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Smarca2Q6DIC0 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Smarca2Q6DIC0 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Smarca2Q6DIC0 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Smarca2Q6DIC0 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smarca2Q6DIC0 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smarca2Q6DIC0 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smarca2Q6DIC0 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smarca2Q6DIC0 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Smarca2Q6DIC0 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smarca2Q6DIC0 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smarca2Q6DIC0 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smarca2Q6DIC0 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smarca2Q6DIC0 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smarca2Q6DIC0 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smarca2Q6DIC0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smarca2Q6DIC0 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smarca2Q6DIC0 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smarca2Q6DIC0 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smarca2Q6DIC0 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smarca2Q6DIC0 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Smarca2Q6DIC0 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smarca2Q6DIC0 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smarca2Q6DIC0 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Smarca2Q6DIC0 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Smarca2Q6DIC0 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Smarca2Q6DIC0 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Smarca2Q6DIC0 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Smarca2Q6DIC0 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Smarca2Q6DIC0 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Smarca2Q6DIC0 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Smarca2Q6DIC0 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Smarca2Q6DIC0 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Smarca2Q6DIC0 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Smarca2Q6DIC0 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Smarca2Q6DIC0 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Smarca2Q6DIC0 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Smarca2Q6DIC0 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smarca2Q6DIC0 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smarca2Q6DIC0 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smarca2Q6DIC0 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smarca2Q6DIC0 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Smarca2Q6DIC0 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Smarca2Q6DIC0 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Smarca2Q6DIC0 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Smarca2Q6DIC0 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Smarca2Q6DIC0 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Smarca2Q6DIC0 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Smarca2Q6DIC0 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smarca2Q6DIC0 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smarca2Q6DIC0 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smarca2Q6DIC0 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Smarca2Q6DIC0 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Smarca2Q6DIC0 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Smarca2Q6DIC0 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Smarca2Q6DIC0 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Smarca2Q6DIC0 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smarca2Q6DIC0 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smarca2Q6DIC0 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smarca2Q6DIC0 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smarca2Q6DIC0 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smarca2Q6DIC0 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smarca2Q6DIC0 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smarca2Q6DIC0 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smarca2Q6DIC0 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smarca2Q6DIC0 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smarca2Q6DIC0 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smarca2Q6DIC0 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smarca2Q6DIC0 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Smarca2Q6DIC0 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smarca2Q6DIC0 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smarca2Q6DIC0 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smarca2Q6DIC0 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smarca2Q6DIC0 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smarca2Q6DIC0 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smarca2Q6DIC0 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smarca2Q6DIC0 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smarca2Q6DIC0 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms