Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFV6

Fndc3c1, Fibronectin type III domain containing protein 3C1, mousemouse

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Length 1,356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3c1Q6DFV6 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fndc3c1Q6DFV6 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fndc3c1Q6DFV6 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fndc3c1Q6DFV6 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fndc3c1Q6DFV6 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fndc3c1Q6DFV6 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fndc3c1Q6DFV6 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fndc3c1Q6DFV6 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fndc3c1Q6DFV6 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fndc3c1Q6DFV6 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fndc3c1Q6DFV6 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fndc3c1Q6DFV6 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fndc3c1Q6DFV6 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fndc3c1Q6DFV6 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Fndc3c1Q6DFV6 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fndc3c1Q6DFV6 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fndc3c1Q6DFV6 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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Fndc3c1Q6DFV6 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fndc3c1Q6DFV6 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fndc3c1Q6DFV6 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Fndc3c1Q6DFV6 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fndc3c1Q6DFV6 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Fndc3c1Q6DFV6 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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Fndc3c1Q6DFV6 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fndc3c1Q6DFV6 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fndc3c1Q6DFV6 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Fndc3c1Q6DFV6 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fndc3c1Q6DFV6 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Fndc3c1Q6DFV6 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fndc3c1Q6DFV6 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Fndc3c1Q6DFV6 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fndc3c1Q6DFV6 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fndc3c1Q6DFV6 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Fndc3c1Q6DFV6 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fndc3c1Q6DFV6 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Fndc3c1Q6DFV6 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fndc3c1Q6DFV6 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fndc3c1Q6DFV6 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fndc3c1Q6DFV6 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fndc3c1Q6DFV6 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fndc3c1Q6DFV6 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fndc3c1Q6DFV6 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Fndc3c1Q6DFV6 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Fndc3c1Q6DFV6 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Fndc3c1Q6DFV6 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Fndc3c1Q6DFV6 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Fndc3c1Q6DFV6 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fndc3c1Q6DFV6 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fndc3c1Q6DFV6 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fndc3c1Q6DFV6 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fndc3c1Q6DFV6 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fndc3c1Q6DFV6 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fndc3c1Q6DFV6 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fndc3c1Q6DFV6 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fndc3c1Q6DFV6 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fndc3c1Q6DFV6 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fndc3c1Q6DFV6 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fndc3c1Q6DFV6 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fndc3c1Q6DFV6 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fndc3c1Q6DFV6 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fndc3c1Q6DFV6 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fndc3c1Q6DFV6 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fndc3c1Q6DFV6 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fndc3c1Q6DFV6 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fndc3c1Q6DFV6 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fndc3c1Q6DFV6 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fndc3c1Q6DFV6 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fndc3c1Q6DFV6 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fndc3c1Q6DFV6 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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