Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc18Q640L5 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc18Q640L5 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc18Q640L5 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc18Q640L5 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc18Q640L5 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc18Q640L5 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc18Q640L5 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc18Q640L5 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc18Q640L5 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc18Q640L5 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc18Q640L5 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc18Q640L5 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc18Q640L5 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc18Q640L5 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc18Q640L5 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc18Q640L5 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc18Q640L5 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc18Q640L5 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc18Q640L5 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc18Q640L5 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc18Q640L5 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc18Q640L5 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc18Q640L5 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc18Q640L5 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc18Q640L5 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc18Q640L5 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc18Q640L5 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc18Q640L5 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc18Q640L5 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc18Q640L5 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc18Q640L5 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc18Q640L5 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc18Q640L5 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc18Q640L5 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc18Q640L5 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc18Q640L5 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc18Q640L5 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc18Q640L5 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc18Q640L5 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc18Q640L5 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc18Q640L5 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc18Q640L5 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc18Q640L5 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc18Q640L5 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc18Q640L5 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc18Q640L5 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc18Q640L5 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc18Q640L5 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc18Q640L5 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc18Q640L5 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc18Q640L5 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc18Q640L5 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc18Q640L5 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc18Q640L5 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc18Q640L5 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc18Q640L5 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc18Q640L5 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc18Q640L5 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc18Q640L5 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc18Q640L5 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc18Q640L5 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc18Q640L5 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc18Q640L5 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc18Q640L5 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc18Q640L5 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc18Q640L5 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc18Q640L5 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc18Q640L5 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc18Q640L5 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc18Q640L5 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc18Q640L5 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc18Q640L5 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc18Q640L5 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc18Q640L5 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc18Q640L5 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc18Q640L5 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc18Q640L5 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc18Q640L5 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc18Q640L5 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc18Q640L5 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc18Q640L5 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc18Q640L5 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc18Q640L5 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc18Q640L5 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc18Q640L5 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc18Q640L5 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc18Q640L5 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc18Q640L5 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc18Q640L5 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc18Q640L5 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc18Q640L5 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc18Q640L5 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc18Q640L5 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc18Q640L5 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc18Q640L5 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc18Q640L5 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc18Q640L5 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc18Q640L5 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc18Q640L5 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
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