Protein–RNA interactions for Protein: Q63994

Cd33, Myeloid cell surface antigen CD33, mousemouse

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd33Q63994 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd33Q63994 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd33Q63994 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd33Q63994 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd33Q63994 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd33Q63994 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd33Q63994 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd33Q63994 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd33Q63994 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cd33Q63994 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cd33Q63994 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cd33Q63994 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cd33Q63994 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cd33Q63994 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cd33Q63994 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cd33Q63994 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cd33Q63994 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cd33Q63994 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd33Q63994 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd33Q63994 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd33Q63994 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd33Q63994 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd33Q63994 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd33Q63994 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd33Q63994 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd33Q63994 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd33Q63994 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd33Q63994 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd33Q63994 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd33Q63994 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd33Q63994 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd33Q63994 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd33Q63994 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd33Q63994 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd33Q63994 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd33Q63994 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd33Q63994 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd33Q63994 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd33Q63994 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd33Q63994 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd33Q63994 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd33Q63994 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd33Q63994 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd33Q63994 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd33Q63994 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd33Q63994 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd33Q63994 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd33Q63994 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd33Q63994 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd33Q63994 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd33Q63994 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd33Q63994 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd33Q63994 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd33Q63994 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd33Q63994 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd33Q63994 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd33Q63994 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd33Q63994 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd33Q63994 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd33Q63994 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd33Q63994 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd33Q63994 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd33Q63994 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd33Q63994 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd33Q63994 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd33Q63994 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd33Q63994 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd33Q63994 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd33Q63994 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd33Q63994 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd33Q63994 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd33Q63994 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd33Q63994 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd33Q63994 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd33Q63994 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd33Q63994 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd33Q63994 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd33Q63994 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd33Q63994 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd33Q63994 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd33Q63994 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd33Q63994 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd33Q63994 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd33Q63994 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd33Q63994 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd33Q63994 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd33Q63994 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd33Q63994 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd33Q63994 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd33Q63994 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd33Q63994 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd33Q63994 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd33Q63994 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd33Q63994 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd33Q63994 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd33Q63994 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd33Q63994 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd33Q63994 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd33Q63994 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd33Q63994 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms