Protein–RNA interactions for Protein: Q62425

Ndufa4, Cytochrome c oxidase subunit NDUFA4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 82 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa4Q62425 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ndufa4Q62425 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ndufa4Q62425 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ndufa4Q62425 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ndufa4Q62425 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ndufa4Q62425 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ndufa4Q62425 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ndufa4Q62425 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ndufa4Q62425 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ndufa4Q62425 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ndufa4Q62425 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ndufa4Q62425 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ndufa4Q62425 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ndufa4Q62425 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ndufa4Q62425 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ndufa4Q62425 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ndufa4Q62425 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ndufa4Q62425 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ndufa4Q62425 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ndufa4Q62425 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ndufa4Q62425 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ndufa4Q62425 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ndufa4Q62425 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ndufa4Q62425 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ndufa4Q62425 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ndufa4Q62425 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ndufa4Q62425 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ndufa4Q62425 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ndufa4Q62425 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ndufa4Q62425 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ndufa4Q62425 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ndufa4Q62425 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ndufa4Q62425 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ndufa4Q62425 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ndufa4Q62425 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ndufa4Q62425 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ndufa4Q62425 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ndufa4Q62425 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ndufa4Q62425 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ndufa4Q62425 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ndufa4Q62425 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ndufa4Q62425 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ndufa4Q62425 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ndufa4Q62425 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ndufa4Q62425 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ndufa4Q62425 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ndufa4Q62425 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ndufa4Q62425 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ndufa4Q62425 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ndufa4Q62425 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ndufa4Q62425 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ndufa4Q62425 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ndufa4Q62425 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ndufa4Q62425 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ndufa4Q62425 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ndufa4Q62425 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ndufa4Q62425 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ndufa4Q62425 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ndufa4Q62425 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ndufa4Q62425 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ndufa4Q62425 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ndufa4Q62425 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Ndufa4Q62425 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ndufa4Q62425 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ndufa4Q62425 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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