Protein–RNA interactions for Protein: Q62159

Rhoc, Rho-related GTP-binding protein RhoC, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhocQ62159 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RhocQ62159 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RhocQ62159 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RhocQ62159 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RhocQ62159 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RhocQ62159 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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RhocQ62159 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RhocQ62159 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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RhocQ62159 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RhocQ62159 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RhocQ62159 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RhocQ62159 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RhocQ62159 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RhocQ62159 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RhocQ62159 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RhocQ62159 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RhocQ62159 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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RhocQ62159 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RhocQ62159 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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RhocQ62159 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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RhocQ62159 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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RhocQ62159 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RhocQ62159 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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RhocQ62159 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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RhocQ62159 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RhocQ62159 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RhocQ62159 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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RhocQ62159 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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RhocQ62159 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RhocQ62159 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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RhocQ62159 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RhocQ62159 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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RhocQ62159 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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RhocQ62159 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RhocQ62159 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RhocQ62159 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
RhocQ62159 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RhocQ62159 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RhocQ62159 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RhocQ62159 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RhocQ62159 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RhocQ62159 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RhocQ62159 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RhocQ62159 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RhocQ62159 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RhocQ62159 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RhocQ62159 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RhocQ62159 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RhocQ62159 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RhocQ62159 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RhocQ62159 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RhocQ62159 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RhocQ62159 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RhocQ62159 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RhocQ62159 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RhocQ62159 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RhocQ62159 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RhocQ62159 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RhocQ62159 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RhocQ62159 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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