Protein–RNA interactions for Protein: Q61809

Lrrn1, Leucine-rich repeat neuronal protein 1, mousemouse

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Length 716 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn1Q61809 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Lrrn1Q61809 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrrn1Q61809 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrrn1Q61809 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrrn1Q61809 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrrn1Q61809 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Lrrn1Q61809 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrrn1Q61809 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Lrrn1Q61809 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Lrrn1Q61809 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrrn1Q61809 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Lrrn1Q61809 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrrn1Q61809 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lrrn1Q61809 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Lrrn1Q61809 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lrrn1Q61809 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Lrrn1Q61809 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Lrrn1Q61809 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Lrrn1Q61809 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Lrrn1Q61809 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lrrn1Q61809 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lrrn1Q61809 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lrrn1Q61809 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lrrn1Q61809 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lrrn1Q61809 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Lrrn1Q61809 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lrrn1Q61809 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lrrn1Q61809 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lrrn1Q61809 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lrrn1Q61809 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lrrn1Q61809 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lrrn1Q61809 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lrrn1Q61809 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lrrn1Q61809 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lrrn1Q61809 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lrrn1Q61809 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lrrn1Q61809 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lrrn1Q61809 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lrrn1Q61809 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lrrn1Q61809 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
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Lrrn1Q61809 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Lrrn1Q61809 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lrrn1Q61809 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms