Protein–RNA interactions for Protein: Q61687

Atrx, Transcriptional regulator ATRX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrxQ61687 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC13□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
AtrxQ61687 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms