Protein–RNA interactions for Protein: Q61644

Pacsin1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin1Q61644 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pacsin1Q61644 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms