Protein–RNA interactions for Protein: Q61220

Nell2, Protein kinase C-binding protein NELL2, mousemouse

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Length 819 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nell2Q61220 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nell2Q61220 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nell2Q61220 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nell2Q61220 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nell2Q61220 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nell2Q61220 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nell2Q61220 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nell2Q61220 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nell2Q61220 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nell2Q61220 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nell2Q61220 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nell2Q61220 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nell2Q61220 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nell2Q61220 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nell2Q61220 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nell2Q61220 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nell2Q61220 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nell2Q61220 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nell2Q61220 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nell2Q61220 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nell2Q61220 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nell2Q61220 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nell2Q61220 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Nell2Q61220 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nell2Q61220 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nell2Q61220 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nell2Q61220 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nell2Q61220 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nell2Q61220 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nell2Q61220 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nell2Q61220 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Nell2Q61220 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nell2Q61220 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nell2Q61220 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nell2Q61220 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nell2Q61220 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nell2Q61220 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Nell2Q61220 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nell2Q61220 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Nell2Q61220 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nell2Q61220 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Nell2Q61220 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nell2Q61220 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nell2Q61220 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nell2Q61220 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nell2Q61220 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nell2Q61220 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Nell2Q61220 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nell2Q61220 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Nell2Q61220 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nell2Q61220 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nell2Q61220 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Nell2Q61220 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nell2Q61220 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nell2Q61220 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nell2Q61220 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nell2Q61220 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nell2Q61220 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nell2Q61220 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nell2Q61220 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nell2Q61220 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Nell2Q61220 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nell2Q61220 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nell2Q61220 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nell2Q61220 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nell2Q61220 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nell2Q61220 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nell2Q61220 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nell2Q61220 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nell2Q61220 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nell2Q61220 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nell2Q61220 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nell2Q61220 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nell2Q61220 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nell2Q61220 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nell2Q61220 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nell2Q61220 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nell2Q61220 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nell2Q61220 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nell2Q61220 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nell2Q61220 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Nell2Q61220 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nell2Q61220 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nell2Q61220 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nell2Q61220 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nell2Q61220 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Nell2Q61220 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nell2Q61220 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nell2Q61220 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nell2Q61220 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms