Protein–RNA interactions for Protein: Q61003

Cd6, T-cell differentiation antigen CD6, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd6Q61003 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd6Q61003 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd6Q61003 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd6Q61003 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd6Q61003 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd6Q61003 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd6Q61003 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd6Q61003 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd6Q61003 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd6Q61003 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd6Q61003 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd6Q61003 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd6Q61003 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd6Q61003 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd6Q61003 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd6Q61003 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd6Q61003 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd6Q61003 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd6Q61003 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd6Q61003 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd6Q61003 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd6Q61003 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd6Q61003 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd6Q61003 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd6Q61003 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd6Q61003 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd6Q61003 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd6Q61003 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd6Q61003 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cd6Q61003 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd6Q61003 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd6Q61003 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd6Q61003 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd6Q61003 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd6Q61003 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd6Q61003 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd6Q61003 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd6Q61003 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd6Q61003 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd6Q61003 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd6Q61003 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd6Q61003 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd6Q61003 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd6Q61003 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd6Q61003 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd6Q61003 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd6Q61003 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd6Q61003 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd6Q61003 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd6Q61003 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd6Q61003 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd6Q61003 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd6Q61003 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd6Q61003 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Cd6Q61003 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd6Q61003 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd6Q61003 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd6Q61003 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd6Q61003 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd6Q61003 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd6Q61003 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cd6Q61003 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd6Q61003 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd6Q61003 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd6Q61003 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd6Q61003 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd6Q61003 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd6Q61003 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd6Q61003 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd6Q61003 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd6Q61003 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd6Q61003 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd6Q61003 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd6Q61003 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd6Q61003 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd6Q61003 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd6Q61003 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd6Q61003 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd6Q61003 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd6Q61003 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd6Q61003 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd6Q61003 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd6Q61003 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd6Q61003 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd6Q61003 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd6Q61003 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd6Q61003 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd6Q61003 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cd6Q61003 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd6Q61003 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd6Q61003 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd6Q61003 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd6Q61003 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd6Q61003 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd6Q61003 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd6Q61003 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd6Q61003 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd6Q61003 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd6Q61003 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms