Protein–RNA interactions for Protein: Q60973

Rbbp7, Histone-binding protein RBBP7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp7Q60973 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rbbp7Q60973 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Rbbp7Q60973 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Rbbp7Q60973 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Rbbp7Q60973 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Rbbp7Q60973 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Rbbp7Q60973 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms